Le bilan de compétences (BC) se déroule suivant 3 phases, conformément au cadre légal et réglementaire en vigueur (art. L6313-1, L6313-4, R6313-4 à R6313-8, L6323-1 à L6323-9, D6323-6 à D6323-8 du Code du travail):

- une phase préliminaire, qui doit permettre au bénéficiaire de s'engager dans la
démarche (définition d'objectifs),
- une phase d'investigation qui a pour objet l'analyse des motivations, compétences et possibilités d'évolution du bénéficiaire,
- une phase de conclusions qui synthétise les éléments du bilan afin de dégager les
perspectives d'actions. Une synthése écrite est remise au bénéficiaire à la fin de cette phase.

La pédagogie utilisée vise à rendre le bénéficiaire acteur de son bilan afin qu'il puisse s'approprier les résultats et les mettre en œuvre. Ainsi toutes les étapes du BC sont réalisées conjointement avec le bénéficiaire, de l'analyse des besoins à l'investigation, jusqu'à la rédaction de la synthèse du BC. Il est de plus invité à travailler sur des documents d'auto-évaluation ainsi qu'à effectuer les recherches nécessaires à la mise en place de son parcours. Le BC favorise une pédagogie centrée sur la personne (ADVP - Conselling de C. Rogers).