Sous la responsabilité de son chef d'établissement, l'APTRL anime la démarche de prévention initiée par sa direction qui en est le pilote. À partir du diagnostic Santé et sécurité du travail (SST), il élabore un ou des projets de prévention des risques professionnels qu'il pilote en relation avec les acteurs de prévention internes ou externes de l'entreprise. Il conduit ses projets, selon les besoins de l'entreprise (Risques routiers, RPS, TMS, chutes…), comme par exemple, un projet de prévention des TMS selon les exigences et attentes du programme national TMS Pros.