Utilisation de l-outil ADN environnemental de l-echantillonnage a l-analyse bioinformatique

Evertéa FEE (Formation Edition Expertise)

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  • 43 - Haute-Loire
  • 63 - Puy-de-Dôme
  • 69 - Rhône
  • 73 - Savoie
  • 74 - Haute-Savoie
Objectifs
Jour 1 : Comprendre comment l'outil ADN environnemental peut être utilisé et pour quels objectifs, quelles sont les différentes étapes de l'analyse et les précautions à prendre lors de ces étapes.
Jour 2 : Comprendre comment sont analysée des données de séquençage de métabarcoding ADNe. Savoir, dans les grandes lignes reproduire une telle analyse sur son propre jeu de données.

 
Programme
Appréhender l'utilisation de l'ADN environnemental pour la biosurveillance des milieux aquatiques

L'outil ADN environnemental 1

Introduction et principes de la technique ADNe

L'outil ADN environnemental 2

Processus d'analyses, interprétation des résultats et cas d'études conclusion et évaluation des acquis fin de journée

Formations aux outils bioinformatiques

Le marqueur analysé et les données et le processus d'analyse, filtrage avec les Obitools

Formation aux outils bioinformatiques 2

le filtrage avec metabarR et visualisation des résultats Conclusion

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